Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIAA1549LQ6ZVL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms