Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPOCD1Q6ZMY3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPOCD1Q6ZMY3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPOCD1Q6ZMY3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPOCD1Q6ZMY3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms