Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RANBP10Q6VN20 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RANBP10Q6VN20 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RANBP10Q6VN20 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms