Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP17L2Q6R6M4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L2Q6R6M4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L2Q6R6M4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP17L2Q6R6M4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L2Q6R6M4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms