Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ZBED9Q6R2W3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZBED9Q6R2W3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBED9Q6R2W3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZBED9Q6R2W3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZBED9Q6R2W3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZBED9Q6R2W3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms