Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZCCHC12Q6PEW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZCCHC12Q6PEW1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZCCHC12Q6PEW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms