Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CNNM4Q6P4Q7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CNNM4Q6P4Q7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CNNM4Q6P4Q7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms