Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN4Q6P4A7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFXN4Q6P4A7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms