Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LCN12Q6JVE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LCN12Q6JVE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LCN12Q6JVE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms