Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RCSD1Q6JBY9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RCSD1Q6JBY9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RCSD1Q6JBY9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCSD1Q6JBY9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCSD1Q6JBY9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms