Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms