Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCNX4Q63HM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNX4Q63HM2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCNX4Q63HM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms