Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.82
CCDC18Q5T9S5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CCDC18Q5T9S5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC18Q5T9S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC18Q5T9S5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC18Q5T9S5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC18Q5T9S5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms