Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMTC4Q5T4D3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMTC4Q5T4D3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms