Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LDLRAP1Q5SW96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LDLRAP1Q5SW96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LDLRAP1Q5SW96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDLRAP1Q5SW96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms