Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL4Q5MAI5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL4Q5MAI5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDKL4Q5MAI5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDKL4Q5MAI5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms