Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC27A3Q5K4L6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SLC27A3Q5K4L6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLC27A3Q5K4L6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLC27A3Q5K4L6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC27A3Q5K4L6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC27A3Q5K4L6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
SLC27A3Q5K4L6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC27A3Q5K4L6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC27A3Q5K4L6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms