Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HABP4Q5JVS0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HABP4Q5JVS0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HABP4Q5JVS0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HABP4Q5JVS0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms