Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCID2Q5JVF3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCID2Q5JVF3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCID2Q5JVF3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCID2Q5JVF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms