Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD3Q5JSP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGD3Q5JSP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD3Q5JSP0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD3Q5JSP0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms