Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITRM1Q5JRX3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITRM1Q5JRX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITRM1Q5JRX3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
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