Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COX19Q49B96 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX19Q49B96 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX19Q49B96 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms