Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3ZCU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3ZCU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3ZCU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3ZCU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3ZCU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3ZCU0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3ZCU0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3ZCU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms