Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLA2G4EQ3MJ16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLA2G4EQ3MJ16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLA2G4EQ3MJ16 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLA2G4EQ3MJ16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms