Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KRTAP21-3Q3LHN1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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