Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V0

MS4A18, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 18, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A18Q3C1V0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A18Q3C1V0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A18Q3C1V0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A18Q3C1V0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A18Q3C1V0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms