Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHL40Q2TBA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KLHL40Q2TBA0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KLHL40Q2TBA0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KLHL40Q2TBA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL40Q2TBA0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms