Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC5A9Q2M3M2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A9Q2M3M2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A9Q2M3M2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A9Q2M3M2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms