Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C17orf58Q2M2W7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C17orf58Q2M2W7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C17orf58Q2M2W7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms