Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIDA1Q1XH10 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SKIDA1Q1XH10 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKIDA1Q1XH10 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKIDA1Q1XH10 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
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