Protein–RNA interactions for Protein: Q1W4C9

SPINK13, Serine protease inhibitor Kazal-type 13, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK13Q1W4C9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINK13Q1W4C9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPINK13Q1W4C9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPINK13Q1W4C9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms