Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LONRF2Q1L5Z9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF2Q1L5Z9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF2Q1L5Z9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF2Q1L5Z9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF2Q1L5Z9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LONRF2Q1L5Z9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms