Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN21Q16825 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTPN21Q16825 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN21Q16825 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN21Q16825 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN21Q16825 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPN21Q16825 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPN21Q16825 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN21Q16825 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN21Q16825 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPN21Q16825 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN21Q16825 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN21Q16825 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPN21Q16825 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPN21Q16825 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPN21Q16825 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPN21Q16825 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN21Q16825 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTPN21Q16825 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPN21Q16825 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPN21Q16825 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPN21Q16825 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPN21Q16825 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPN21Q16825 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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