Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIST3H3Q16695 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIST3H3Q16695 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIST3H3Q16695 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
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