Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FOXD1Q16676 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.42
FOXD1Q16676 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
FOXD1Q16676 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FOXD1Q16676 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FOXD1Q16676 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
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