Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 SEMA4G-207ENST00000518244 652 ntTSL 316.41■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 SEMA4G-206ENST00000518124 596 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 SEMA4G-209ENST00000519649 2024 ntTSL 512.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 BCAR1-222ENST00000569340 714 ntTSL 310.47□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-8■■■■□ 21.7
SRSF7Q16629 TCF3-210ENST00000587235 986 ntTSL 519.82■□□□□ 0.761e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 MYRF-206ENST00000537766 1392 ntTSL 319.39■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-207ENST00000549633 1076 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-209ENST00000551506 586 ntTSL 314□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TEPSIN-207ENST00000573295 2552 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-208ENST00000586318 631 ntTSL 313.71□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 VWCE-203ENST00000398808 717 ntTSL 312.7□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 VWCE-201ENST00000301770 3368 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-227ENST00000523576 860 ntTSL 311.79□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TEPSIN-204ENST00000571115 551 ntTSL 311.44□□□□□ -0.581e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 TEPSIN-212ENST00000576090 3642 ntTSL 210.22□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-227ENST00000526570 5528 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 21.6
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SRSF7Q16629 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 29.28□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 59.25□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-215ENST00000464163 545 ntTSL 49.23□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-219ENST00000475621 485 ntTSL 28.48□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SOX5-212ENST00000541536 2365 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.091e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.551e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.631e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)1.98□□□□□ -2.091e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.479e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.149e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 KLHL17-202ENST00000463212 955 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.169e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 PLXNB2-212ENST00000496720 913 ntTSL 314.03□□□□□ -0.169e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ATM-213ENST00000527891 595 ntTSL 313.24□□□□□ -0.299e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 213.22□□□□□ -0.299e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ATM-212ENST00000527805 4841 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.449e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.539e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.589e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ATM-219ENST00000532931 481 ntTSL 310.14□□□□□ -0.799e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 210.1□□□□□ -0.799e-6■■■■□ 21.6
SRSF7Q16629 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.159e-6■■■■□ 21.6
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