Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYPL1Q16563 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYPL1Q16563 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYPL1Q16563 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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