Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VPS72Q15906 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VPS72Q15906 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
VPS72Q15906 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VPS72Q15906 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VPS72Q15906 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VPS72Q15906 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms