Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NCOA1Q15788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NCOA1Q15788 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
NCOA1Q15788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NCOA1Q15788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NCOA1Q15788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
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