Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HMGN3Q15651 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HMGN3Q15651 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGN3Q15651 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HMGN3Q15651 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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