Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT3Q15649 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT3Q15649 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT3Q15649 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT3Q15649 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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