Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAM1Q15629 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAM1Q15629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAM1Q15629 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAM1Q15629 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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