Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TAF13Q15543 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TAF13Q15543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF13Q15543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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