Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SKIV2LQ15477 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKIV2LQ15477 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIV2LQ15477 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIV2LQ15477 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms