Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 RPL23-205ENST00000470646 333 ntTSL 311.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 56.4
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SF3B4Q15427 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 56.2
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SF3B4Q15427 RAP1GAP-202ENST00000317967 600 ntTSL 214.1□□□□□ -0.155e-15■■■■■ 56.2
SF3B4Q15427 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 210.51□□□□□ -0.735e-15■■■■■ 56.2
SF3B4Q15427 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 56.26□□□□□ -1.415e-19■■■■■ 56.2
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SF3B4Q15427 SND1-212ENST00000485871 597 ntTSL 39.98□□□□□ -0.812e-14■■■■■ 56.2
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SF3B4Q15427 CEP250-211ENST00000474829 356 ntTSL 34.93□□□□□ -1.621e-8■■■■■ 56.1
SF3B4Q15427 RPL18-216ENST00000552851 691 ntTSL 511.17□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 56
SF3B4Q15427 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 210.74□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 56
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SF3B4Q15427 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 24.08□□□□□ -1.765e-17■■■■■ 56
SF3B4Q15427 HDAC5-206ENST00000587776 917 ntTSL 313.91□□□□□ -0.184e-13■■■■■ 55.9
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SF3B4Q15427 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.497e-12■■■■■ 55.9
SF3B4Q15427 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.517e-12■■■■■ 55.9
SF3B4Q15427 PPP1R8-204ENST00000431586 1029 ntTSL 311.46□□□□□ -0.577e-12■■■■■ 55.9
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SF3B4Q15427 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.119e-14■■■■■ 55.9
SF3B4Q15427 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 215.33■□□□□ 0.049e-14■■■■■ 55.9
SF3B4Q15427 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.019e-14■■■■■ 55.9
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SF3B4Q15427 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.119e-14■■■■■ 55.9
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SF3B4Q15427 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.21e-25■■■■■ 55.9
SF3B4Q15427 RPL13-207ENST00000484610 924 ntTSL 513.59□□□□□ -0.231e-25■■■■■ 55.9
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SF3B4Q15427 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-25■■■■■ 55.9
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SF3B4Q15427 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 55.8
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SF3B4Q15427 TRAP1-207ENST00000571804 781 ntTSL 521.16■□□□□ 0.987e-12■■■■■ 55.7
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SF3B4Q15427 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.562e-29■■■■■ 55.7
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SF3B4Q15427 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-16■■■■■ 55.7
SF3B4Q15427 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-16■■■■■ 55.7
SF3B4Q15427 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-16■■■■■ 55.7
SF3B4Q15427 FANCA-218ENST00000565582 812 ntTSL 310.82□□□□□ -0.681e-16■■■■■ 55.7
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SF3B4Q15427 XPO1-221ENST00000489954 583 ntTSL 44.97□□□□□ -1.611e-19■■■■■ 55.6
SF3B4Q15427 PCBP2-214ENST00000549272 445 ntTSL 24.26□□□□□ -1.738e-11■■■■■ 55.6
SF3B4Q15427 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 TESMIN-206ENST00000540869 724 ntTSL 310.57□□□□□ -0.722e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 AGPAT3-209ENST00000448845 392 ntTSL 59.55□□□□□ -0.882e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 TESMIN-203ENST00000438124 657 ntTSL 39.1□□□□□ -0.952e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 OTUD6B-204ENST00000524027 1330 ntTSL 1 (best)5.83□□□□□ -1.482e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 CCDC125-207ENST00000513172 675 ntTSL 33.66□□□□□ -1.822e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 GTF2IRD1-206ENST00000486086 440 ntTSL 23.14□□□□□ -1.912e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 KLC1-221ENST00000556986 1150 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.723e-12■■■■■ 55.5
SF3B4Q15427 DIP2A-206ENST00000472364 2542 ntTSL 211.86□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-208ENST00000532972 839 ntTSL 216.22■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-204ENST00000527225 321 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 SPCS2-206ENST00000528265 577 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 ABCD4-220ENST00000553998 478 ntTSL 37.04□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 55.4
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