Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKD1Q15139 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKD1Q15139 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKD1Q15139 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKD1Q15139 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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