Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD3Q15059 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRD3Q15059 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRD3Q15059 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRD3Q15059 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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