Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
GAPVD1Q14C86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.58■■■■■ 4.25
GAPVD1Q14C86 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
GAPVD1Q14C86 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
GAPVD1Q14C86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
GAPVD1Q14C86 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.37■■■■■ 4.21
GAPVD1Q14C86 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
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