Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAB33AQ14088 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB33AQ14088 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB33AQ14088 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB33AQ14088 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB33AQ14088 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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