Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CBFBQ13951 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CBFBQ13951 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CBFBQ13951 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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